一、常用微生物检测技术
1.染色技术
染色技术则是对微生物细胞进行染色后，对微生物进行观察检测的一种技术，不过由于染色后微生物标准基本是死的，其形态和结构会在染色过程中发生一定变化，无法切实反应出活细胞的真实情况，因此通常只作为辅助检测手段。在实际操作中，整个流程也较为繁琐，染色、脱色都需要严格控制，否则将会影响检测结果的准确性。
2.分离纯化技术
自然环境中的微生物通常是杂居混生的，在微生物检测中需要对混生微生物群体进行分离纯化，以对纯微生物进行检测的技术，分离纯化技术常用于菌种鉴定中，分离纯化技术是微生物检测的一项重要技术，是微生物检测的重要基础。
3.其它技术
在微生物常规检测中，通常对微生物进行形态结构、培养特性方面的观察，再利用化学反应来测定微生物的代谢物，以鉴别一些形态和其它方面不易区别的微生物，以更好的进行微生物分类鉴定。近年来，在环境监测中，微生物检测技术运用方法较为广泛，如运用细菌总数和粪便污染指示菌监测水质，运用发光细菌检测环境有毒物质，运用水中藻类生长量监测水质或物质霉性等等，这些方法都已经有了较为成熟的操作手段和检验标准，具有较强的实践价值。
二、环境监测中常用微生物检测技术
1.微生物群落监测
微生物群落监测是一种较为经济、快速、有效的微生物检测方法，被广泛应用于各种废水、土壤、空气监测中。如重金属、农业、石油、化工、冶炼、食品加工、制药、绵纺、化肥、生活污水等方面，即大量运用了微生物群落监测技术。由于环境污染物的含量会随着时间变化而变化，会随着其它环境条件的变化而且变化，因此对一定区域内的微生物群落进行监测，能更好的将一定时间范围内环境污染的变化情况、环境污染历史情况更好的描述出来。目前，急需运用现代微生物群落监测技术，对微生物群落的群落生态、个体生态进行监测，对微生物进行毒性测定、致突变测定，对微生物进行生理、生化指标测定等等。
2.环境污染细菌学监测
环境污染对硅藻生物、丛生植物等生物的影响较为明显，对细菌等异养生物的影响不太生长感。不过环境污染依然会对细菌等异养生物造成巨大的影响，在环境监测中进行细菌学监测，也能获得丰富的数据。在实际环境监测中，通常会利用检验细菌总数的方法，来间接判断环境污染程度，为水污染、土壤污染提供细菌学指标，如通过检验总大肠菌群、烘大肠菌群、粪链球菌、肠道病毒等，能有效判断出水的卫生学质量。虽然空气并非是菌群生长繁殖的天然环境，不存在固定的菌落群，但随着土壤、水、人体等进入空气中，依然可以对空气中的菌落群进行检测以获得环境污染的监测数据。在空气污染监测中，也可以通过对细菌的分布、生长状况、变异特性、生理生化指标、细菌群落系统变化等来研究空气污染情况，测定空气中的污染物毒性。包括如敏感菌群的消失、抗性强菌群的保留和发展、菌群个体的发育状况、菌群适应性的变化、菌群生化反应等等。
3.微生物毒理学监测及其它检测技术
环境污染物除了对人体、动植物造成影响外，对微生物也会造成影响，通过监测微生物对环境污染物的生物效应，进行污染物毒理性质、作用机理、损坏现象等检测，用以探明环境污染物对微生物造成的影响，把握环境中污染物各项指标情况，为环境监测提供早期敏感性指标，判断环境状况和寻求治理路径。此外，还有其它一些近两年得到迅速发展的微生物检测技术，如生物传感器技术、PCR技术、酶免疫技术、核酸探针技术等。生物传感器技术利用微生物传感器，如甲烷生物传感器、氨生物传感器、菌浓度检测器等对环境进行自动、连续检测，能准确及时的获取环境污染信息，具有极高的时效性和灵敏度。PCR技术利用微生物异性DN段，对微生物进行序列分析、基因克隆等获取环境污染信息。
三、微生物检测技术和化学、物理分析法的对比
传统的化学、物理检测方法大多集中针对环境污染物的性质、来源、含量、分布状态等进行检测，所需仪器和设备通常较为复杂，并且部分检测方法存在缺陷，如重量法在环境污染物浓度较低时会产生较大误差，容量法虽然操作方法但灵敏度不高，光学分析法多适用于水和液体试样的分析，在实际应用中，这些方法存在不少不足和缺陷，无法较全面的把握环境污染数据。
微生物检测技术针对微生物对环境污染或环境变化的反应进行监测，所需仪器设备相对物理、化学检测更易操作，且样本受污染影响较小，具有较高的灵敏度、可靠性、稳定性、实时性，并能广泛应用于各种环境的监测之中，从生物学的角度反应出环境污染的情况和历史背景，获取丰富的数据。
作者：杨艳 单位：山东省日照市五莲县环保局